A Bioinformatics Study of Protein Conformational Flexibility and Misfolding: a Sequence, Structure and Dynamics Approach

Espinosa Angarica, Vladimir
Sancho Sanz, Javier (dir.)

Universidad de Zaragoza, 2014

Abstract: This PhD Thesis titled "A Bioinformatics Study of Protein Conformational Flexibility and Misfolding: a Sequence, Structure and Dynamics Approach" comprises the results and conclusions obtained by us from the study of three different but somehow related research projects, covering aspects of the phenomenon of protein local conformational instability, its relationship with protein function, evolvability and aggregation, and the effect of genetic variations on protein conformational instability related to Conformational Diseases. These projects include the prediction of putative prion proteins in complete proteomes and the study of prion biology from a genomic perspective, the prediction of conformationally unstable protein regions and the existence of a structural framework for linking conformational instability to folding and function, and the establishment of a rationale for assessing the connection among mutations and disease phenotypes in Conformational Diseases.

Abstract (other lang.): Esta tesis doctoral comprende los resultados y conclusiones obtenidos por nosotros a partir del estudio de tres proyectos de investigación diferentes pero de alguna manera relacionados, cubriendo los aspectos del fenómeno de la inestabilidad conformacional local de la proteína, su relación con la función de la proteína, la capacidad de evolución y agregación, y el efecto de las variaciones genéticas en la inestabilidad conformacional de la proteína relacionados con las enfermedades conformacionales. Estos proyectos incluyen la predicción de presuntas proteínas priónicas en proteomas complejos y el estudio de la biología de priones desde una perspectiva genómica, la predicción de las regiones de proteínas conformacionalmente inestables y la existencia de un marco estructural para la vinculación de la inestabilidad conformacional del plegado y la función, y el establecimiento de una razón fundamental para la evaluación de la relación entre las mutaciones y fenotipos de la enfermedad en enfermedades conformacionales.

Pal. clave: estructura de polipéptidos y proteínas ; polypeptides and proteins structure

Knowledge area: Bioquímica y biología molecular

Department: Bioquímica y Biología Molecular y Celular

Nota: Presentado: 01 04 2014

Nota: Tesis-Univ. Zaragoza, Bioquímica y Biología Molecular y Celular, 2014