TAZ-TFG-2019-4387


Cálculo de puntos críticos en redes metabólicas microbianas

Oarga Hategan, Alexandru Ioan
Júlvez Bueno, Jorge Emilio (dir.)

Universidad de Zaragoza, EINA, 2019
Informática e Ingeniería de Sistemas department, Lenguajes y Sistemas Informáticos area

Graduado en Ingeniería Informática

Abstract: El creciente número de bacterias multirresistentes a los fármacos y la alta mortalidad provocada por estos microorganismos son un desafío para la comunidad científica y la salud pública. En contraste, la frecuencia de desarrollo de nuevos fármacos es baja a pesar de los avances en la secuenciación genómica y la alta cantidad de datos disponibles de estos microorganismos. En este contexto, la biología de sistemas puede contribuir a la identificación de vulnerabilidades que faciliten el desarrollo de nuevos fármacos. A partir de los datos generados con la experimentación sobre diferentes microorganismos, se han construido a lo largo de los años varios modelos metabólicos de agentes microbianos. Mediante la simulación sobre estos modelos se pueden calcular los puntos que pueden resultar críticos para el metabolismo de un organismo y que por
tanto pueden ser un objetivo terapéutico de interés.
Este trabajo en concreto presenta un procedimiento para el cálculo de reacciones del metabolismo que son las únicas productoras o consumidoras de un compuesto. El trabajo incluye además un enfoque novedoso al utilizar la variabilidad de flujo para el cálculo de las reacciones que son únicas consumidoras o productoras. Además de esto, se calculan los conjuntos de compuestos con un flujo nulo y se estudia el efecto que tiene su eliminación en el cálculo de las anteriores reacciones. También se calculan y comparan junto a estas reacciones los conjuntos de reacciones que se obtienen al
desactivar un gen esencial y las reacciones cuya eliminación interrumpe el crecimiento del agente microbiano. Para producir los resultados anteriores y dar la posibilidad de modificar modelos metabólicos se ha desarrollado además una aplicación de escritorio y una aplicación web.


Tipo de Trabajo Académico: Trabajo Fin de Grado

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