Estadística y cinética de la regulación genética transcripcional

Martínez Urbiola, Isabel
Falo Forniés, Fernando (dir.) ; Fiasconaro, Alessandro (dir.)

Universidad de Zaragoza, CIEN, 2022
Física de la Materia Condensada department, Física de la Materia Condensada area

Graduado en Física

Abstract: A lo largo de este trabajo se han estudiado modelos de procesos de transcripción de ADN en ARN y traducción en proteínas incluyendo efectos estocásticos. Para ello se han simulado varios ejemplos biológicos resolviendo las ecuaciones maestras con el método de Gillespie y las correspondientes ecuaciones diferenciales estocásticas con el método de la ecuación de Langevin, obteniendo resultados equivalentes para situaciones con concentraciones altas de las moléculas.
Concretamente se ha comenzado por el análisis de un modelo sencillo de nacimiento y muerte (sin regulación) de un típico proceso genético de producción de proteínas, al que posteriormente se le añade la regulación por proteínas reguladoras (factores de transcripción) o se le incluye la condición del promotor (región reguladora del gen) de encontrarse en dos estados de activación o inhibición del proceso de transcripción, estudiando la dinámica de las moléculas. Por último, se estudia los efectos de la estocasticidad en los circuitos oscilantes.

Tipo de Trabajo Académico: Trabajo Fin de Grado