126152 20230518085140.0 TAZ-TFG-2022-3717 spa Gómez Ortego, Óscar Fast computational reconstruction of SARS-CoV-2 philogenies. Reconstrucción computacional rápida de árboles filogenéticos de SARS-CoV-2. Zaragoza Universidad de Zaragoza 2022 by-nc-sa Creative Commons 3.0 http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ NCD (Normalized Compressed Distance) es un método de compresión para la creación de filogenias de carácter general. Se inspecciona y se hace uso de este método para formar árboles filogenéticos de COVID-19, ADN mitocondrial y del virus Monkeypox. Exploramos este método con grandes datasets de las fuentes de datos más relevantes, GISAID y Nextstrain, haciendo especial hincapié en esta última y el software que proporciona para el análisis de patógenos. Se han creado árboles filogenéticos de hasta 500 secuencias, con el objetivo de comprobar si el método es apto para grandes filogenias. La comparación de este método con otros de la actualidad basados en el alineamiento de secuencias ha concluido que estos habían avanzado mucho más rápido y obtenían tiempos de ejecución mucho menores que NCD, probablemente debido a la rapidez del proceso de multialineamiento cuando existe una secuencia de referencia. Sin embargo, a nivel cualitativo, los resultados fueron bastante buenos y aptos para el análisis.<br /> Graduado en Ingeniería Informática Derechos regulados por licencia Creative Commons Mayordomo Cámara, Elvira dir. Hernández Giménez, Mónica dir. Universidad de Zaragoza Informática e Ingeniería de Sistemas Lenguajes y Sistemas Informáticos 778572@unizar.es 4740777 http://zaguan.unizar.es/record/126152/files/TAZ-TFG-2022-3717.pdf Memoria (spa) 786911 http://zaguan.unizar.es/record/126152/files/TAZ-TFG-2022-3717_ANE.pdf Anexos (spa) oai:zaguan.unizar.es:126152 driver trabajos-fin-grado TAZ TFG EINA 20220922162457.CREATION_DATE deposita:2023-05-18