SIMULACIONES DE DINÁMICA MOLECULAR PARA DETERMINAR LAS INTERACCIONES DE ANTIRRETROVIRALES CON LA RETROTRANSCRIPTASA INVERSA DE SARS-COV-2

Torres Perales, Ruth
Merino Filella, Pedro (dir.)

Universidad de Zaragoza, CIEN, 2023

Graduado en Química

Abstract: A finales de 2019 se identificaba un nuevo tipo de virus: el SARS-CoV-2 o como comúnmente se le
conoce Covid-19. Este nuevo virus perteneciente a la familia de los coronavirus y se caracteriza por un
RNA monocatenario y una serie de proteínas mediadoras. Dichas proteínas tienen diferentes
funcionalidades como la proteína spike o “S”, que se encarga de la interacción con la célula huésped,
o la RNA polimerasa dependiente de RNA, enzima responsable de la replicación del virus y la cual se
estudia en este trabajo.
En particular, se realiza un análisis de las interacciones entre el complejo RdRp y diferentes ligandos .
En una primera aproximación se realizan estudios de docking para ver la estabilidad de los ligandos
frente a la proteína. A continuación, se realizan las simulaciones de dinámica molecular con los
ligandos escogidos para poder estudiar en detalle las interacciones que tienen lugar con el fin de
determinar qué factores son los responsables del reconocimiento de los sustratos por parte del
enzima. Este tipo de estudios son fundamentales en el diseño de inhibidores de la enzima que
bloqueen su actividad y por tanto, la replicación del virus

Tipo de Trabajo Académico: Trabajo Fin de Grado