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000059121 005__ 20170127103259.0
000059121 037__ $$aTAZ-TFG-2016-2228
000059121 041__ $$aspa
000059121 1001_ $$aPelegrín Costea, Jonás
000059121 24200 $$aComputational simulation for the prediction of an enzyme-inhibitor docking: identification of the binding site of inhibitors of essentials pathogenic flavoenzymes
000059121 24500 $$aSimulación computacional para la predicción de acoplamiento enzima-inhibidor: identificación del sitio de unión de inhibidores de flavoenzimas esencenciales en patógenos
000059121 260__ $$aZaragoza$$bUniversidad de Zaragoza$$c2016
000059121 500__ $$aResumen disponible también en inglés
000059121 506__ $$aby-nc-sa$$bCreative Commons$$c3.0$$uhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/
000059121 520__ $$aXanthomonas axonopodis pv. citri es una bacteria responsable del cáncer de cítricos, una enfermedad que afecta a la calidad de estos. El genoma de este patógeno contiene el gen que codifica la enzima Flavodoxina-NADPH Reductasa (XacFPR), perteneciente a la familia de la Flavodoxina-NADPH Reductasa (FNR). A su vez, la XacFPR se clasifica en la subclase Ia de las FPRs, caracterizada por presentar una alanina enfrentada a la isoaloxacina del cofactor FAD de la proteína y una extensión más corta del dominio C-terminal con respecto a las FPRs de la subclase Ib. XacFPR está involucrada en la respuesta a estrés oxidativo inducida por la planta para combatir al patógeno, por lo que la inhibición de su actividad puede ser un aspecto clave para frenar la supervivencia del patógeno. Por ello resulta de interés identificar cómo los posibles inhibidores interaccionarían con la XacFPR. Sin embargo, teniendo en cuenta que hasta la fecha no existen modelos tridimensionales que representen la interacción de XacFPR con su sustrato, el coenzima NADPH, se hace necesario entender como dicho sustrato se une a esta enzima. El objetivo que se planteó en el presente trabajo fue utilizar herramientas computacionales para simular la interacción de los componentes nucleotídicos del coenzima NADPH con XacFPR. Para ello realizamos el acoplamiento molecular entre la proteína y fragmentos del sustrato. Esta aproximación permite evaluar la energía de interacción entre distintas posiciones relativas de las dos moléculas, para así obtener aquella o aquellas posiciones más favorables.
000059121 521__ $$aGraduado en Química
000059121 540__ $$aDerechos regulados por licencia Creative Commons
000059121 700__ $$aMedina Trullenque, María Milagros$$edir.
000059121 700__ $$aPolo Ortiz, Victoriano$$edir.
000059121 7102_ $$aUniversidad de Zaragoza$$bBioquímica y Biología Molecular y Celular$$cBioquímica y Biología Molecular
000059121 8560_ $$f649915@celes.unizar.es
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