Resumen: La resistencia a los antibióticos (RAM) representa uno de los mayores desafíos actuales para la salud pública global. Aunque se ha estudiado ampliamente en contextos clínicos, su diseminación a través de alimentos fermentados, como los quesos artesanales elaborados con leche cruda, continúa siendo un fenómeno poco explorado. Estos productos, al no someterse a tratamientos térmicos, pueden albergar una elevada carga microbiana, incluyendo bacterias portadoras de genes de resistencia (ARGs). Este estudio tuvo como objetivo caracterizar fenotípica y genotípicamente la resistencia a antibióticos en cuatro quesos artesanales curados de las regiones pirenaicas de Huesca y Lleida. Se realizaron recuentos microbiológicos convencionales para distintos grupos microbianos (bacterias acido-lácticas (BAL), Enterococcus spp., Enterobacterales, mohos y levaduras), evaluando además el crecimiento de BAL y enterococos en medios con antibióticos. Posteriormente, se aplicó secuenciación metagenómica y análisis bioinformático para identificar el perfil taxonómico microbiano y los genes de resistencia presentes en cada muestra. Las BAL fueron el grupo predominante, con variaciones en su abundancia entre muestras, caracterizadas hasta el nivel de especie gracias al análisis metagenómico. La diversidad alfa y beta mostró diferencias significativas entre los lotes, sugiriendo una influencia clara del origen de la leche y del proceso de producción. A nivel genético, se identificaron 215 genes de resistencia a antibióticos, destacando los asociados a β- lactámicos, tetraciclinas, aminoglucósidos y macrólidos. Los recuentos en presencia de antibióticos apoyó la expresión fenotípica de distintos niveles de resistencia en BAL y Enterococcus spp., reforzando los datos metagenómicos. Estos hallazgos evidencian que los quesos curados artesanales podrían actuar como reservorios de ARGs, lo que plantea la importancia de considerarlos en las evaluaciones de seguridad alimentaria. En conclusión, se subraya la necesidad de fortalecer la vigilancia microbiológica en productos fermentados desde una perspectiva “Una Salud”.