Resumen: Este trabajo recoge el análisis de los contenidos del Máster Universitario en Profesorado a través del estudio de dos de los trabajos más relevantes realizados durante el mismo. Ambos proyectos se centran en facilitar la comprensión de los contenidos de Física y Química en la etapa de Educación Secundaria Obligatoria. El primero analiza las causas y posible actuación ante la presencia de ideas alternativas en el alumnado, en concreto en la temática de estructura atómica y enlace químico. El segundo se centra en mostrar una metodología activa y dinámica favoreciendo la implicación del alumnado en su aprendizaje a través de la realización de prácticas de laboratorio dentro del bloque reacciones químicas, con un enfoque divulgativo.