000126152 001__ 126152 000126152 005__ 20230518085140.0 000126152 037__ $$aTAZ-TFG-2022-3717 000126152 041__ $$aspa 000126152 1001_ $$aGómez Ortego, Óscar 000126152 24200 $$aFast computational reconstruction of SARS-CoV-2 philogenies. 000126152 24500 $$aReconstrucción computacional rápida de árboles filogenéticos de SARS-CoV-2. 000126152 260__ $$aZaragoza$$bUniversidad de Zaragoza$$c2022 000126152 506__ $$aby-nc-sa$$bCreative Commons$$c3.0$$uhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ 000126152 520__ $$aNCD (Normalized Compressed Distance) es un método de compresión para la creación de filogenias de carácter general. Se inspecciona y se hace uso de este método para formar árboles filogenéticos de COVID-19, ADN mitocondrial y del virus Monkeypox. Exploramos este método con grandes datasets de las fuentes de datos más relevantes, GISAID y Nextstrain, haciendo especial hincapié en esta última y el software que proporciona para el análisis de patógenos. Se han creado árboles filogenéticos de hasta 500 secuencias, con el objetivo de comprobar si el método es apto para grandes filogenias. La comparación de este método con otros de la actualidad basados en el alineamiento de secuencias ha concluido que estos habían avanzado mucho más rápido y obtenían tiempos de ejecución mucho menores que NCD, probablemente debido a la rapidez del proceso de multialineamiento cuando existe una secuencia de referencia. Sin embargo, a nivel cualitativo, los resultados fueron bastante buenos y aptos para el análisis.<br /> 000126152 521__ $$aGraduado en Ingeniería Informática 000126152 540__ $$aDerechos regulados por licencia Creative Commons 000126152 700__ $$aMayordomo Cámara, Elvira$$edir. 000126152 700__ $$aHernández Giménez, Mónica$$edir. 000126152 7102_ $$aUniversidad de Zaragoza$$bInformática e Ingeniería de Sistemas$$cLenguajes y Sistemas Informáticos 000126152 8560_ $$f778572@unizar.es 000126152 8564_ $$s4740777$$uhttps://zaguan.unizar.es/record/126152/files/TAZ-TFG-2022-3717.pdf$$yMemoria (spa) 000126152 8564_ $$s786911$$uhttps://zaguan.unizar.es/record/126152/files/TAZ-TFG-2022-3717_ANE.pdf$$yAnexos (spa) 000126152 909CO $$ooai:zaguan.unizar.es:126152$$pdriver$$ptrabajos-fin-grado 000126152 950__ $$a 000126152 951__ $$adeposita:2023-05-18 000126152 980__ $$aTAZ$$bTFG$$cEINA 000126152 999__ $$a20220922162457.CREATION_DATE