Regulación génica por REX1 en células troncales. Epigenética de las dianas genómicas.

Marqueta Gracia, José Javier
Schoorlemmer, Jon (dir.) ; Muniesa Lorda, Pedro (dir.)

Universidad de Zaragoza, CIEN, 2016
Anatomía, Embriología y Genética Animal department, Anatomía y Anatomía Patológica Comparadas area

Graduado en Biotecnología

Abstract: Los mecanismos moleculares que están detrás de las funciones reguladoras del factor de transcripción REX1 durante el desarrollo embrional son en muchos aspectos todavía una incógnita. Recientes descubrimientos revelaron que numerosas dianas genómicas de REX1 poseen marcas epigenéticas indicativas de improntas genéticas. En el presente trabajo se llevó a cabo la puesta a punto de ensayos que permiten estudiar el nivel de metilación asociado a dinucleótidos CpG en loci diana de REX1: Nespas, Chd2, PisD y Ly6c1. Para ello, DNA genómico de células madre embrionarias (ES) de ratón fue tratado con bisulfito y se diseñaron experimentos de amplificación para cada locus. Un primer intento de amplificación mediante el uso de un primer de secuencia universal (M13) produjo productos poco o no aptos para la cuantificación mediante pirosecuenciación. Como solución se decide utilizar uno de los primers directamente biotinilado. Resultados de un primer ensayo en el locus Nespas mostró aproximadamente la mitad de metilación en células ES carentes de Rex1 que en células ES wild type (wt). A falta del estudio de loci adicionales para una posible generalización, esta observación sugiere para REX1 un papel protector de la metilación de sus sitios de unión.

Tipo de Trabajo Académico: Trabajo Fin de Grado