El gen tpi como herramienta en los estudios epidemiolo´gicos de la giardiosis
Goñi, M.P. (Universidad de Zaragoza) ; Benito, M. (Universidad de Zaragoza) ; Cieloszyk, J. ; Arango, E. ; LaPlante, D. ; Remacha, M.A. ; Seral, C. (Universidad de Zaragoza) ; Fernandez, M.T. (Universidad de Zaragoza) ; Lafarga, L. ; Rubio, E. (Universidad de Zaragoza)
Resumen: Giardia duodenalis es un protozoo que causa infección en humanos y animales, que se puede transmitir por vía hídrica, de persona a persona o por contacto con animales, siendo una de las infecciones intestinales más frecuentes en nuestro país, por lo que supone una preocupación de Salud Pública. Su estudio epidemiológico, requiere la caracterización molecular de los parásitos, utilizando genes con gran variabilidad como el que codifica la triosafosfatoisomerasa (tpi) y analizando la homología entre aislamientos.
El objetivo del trabajo es establecer el criterio de identidad que permita la comparación epidemiológica de los aislamientos de Giardia.
Se recogieron 2-3 muestras de heces en días alternos, de 26 pacientes con giardiosis. Tras la extracción de ADN, se amplificaron por técnicas de PCR, un fragmento del gen tpi y un fragmento del gen de la beta-giardina (bg), que se utilizó como comparación. Los fragmentos obtenidos fueron secuenciados y las secuencias analizadas con los programas BioEdit y DnaSP v.5.0. Las secuencias del gen tpi mostraron una elevada divergencia, con valores de diversidad ¿ entre 0 y 0, 21219. La aparición de picos múltiples en el cromatograma, indicaron la presencia de varios clones en la misma muestra. Las diferencias entre aislamientos del mismo paciente fueron iguales o mayores que las encontradas para el conjunto de todas las muestras.
La variabilidad del gen tpi no permite establecer unos criterios de identidad, necesarios para la identificación de aislamientos.
Las infecciones mixtas intragenotipo ocurren de una forma muy frecuente, sugiriendo una implicación de la vía ambiental como principal fuente de transmisión o una variación genética muy elevada.
Giardia duodenalis is a protozoon that causes infection in humans and animals. It can be transmitted by contaminated water, from person to person or by contact with animals; it being the cause one of the most common intestinal infections in our country, so it is a public health concern. The epidemiological study thereof requires the molecular characterization of parasites, using genes with great variability, such as the one that codes triosephosphate isomerase (tpi), and analizing the homology between isolates. The purpose of this work is to establish the identity criterion for epidemiological comparison of Giardia isolates. 2-3 stool samples were collected in alternate days from 26 patients with giardiasis. After DNA extraction, a fragment of the tpi gene and a fragment of the beta-giardin (bg) gene-used for comparison purposes-were amplified by means of PCR techniques. The obtained fragments were sequenced and the sequences analyzed with the BioEdit and DnaSP v.5.0 software. The tpi gene sequences showed a high divergence, with values of diversity ¿ ranging from 0 to 0.21219. The appearance of multiple peaks in the chromatogram points to the presence of various clones in the same sample. The differences between isolates from the same patient where equal or higher than those found for the collection of all samples. The variability of the tpi gene does not allow identity criteria to be established, which are necessary for isolate identification. Mixed intragenotype infections occur very frequently, which suggests the environmental path is the principal path of transmission and/or there is very high genetic variability.
Idioma: Español
Año: 2018
Publicado en: Revista de salud ambiental 18, 1 (2018), 78-84
ISSN: 1577-9572
Originalmente disponible en: Texto completo de la revista
Factor impacto SCIMAGO: 0.102 - Public Health, Environmental and Occupational Health (Q4) - Health, Toxicology and Mutagenesis (Q4)
Financiación: info:eu-repo/grantAgreement/ES/DGA/T51-17R
Financiación: info:eu-repo/grantAgreement/ES/ISCIII/FIS/PS09-01585
Financiación: info:eu-repo/grantAgreement/ES/UZ/UZ2013-FIS-02
Tipo y forma: Article (Published version)
Área (Departamento): Área Parasitología (Dpto. Microb.Med.Pr.,Sal.Públ.)
Área (Departamento): Área Enfermería (Dpto. Fisiatría y Enfermería)
Área (Departamento): Área Microbiología (Dpto. Microb.Med.Pr.,Sal.Públ.)
Área (Departamento): Área Medic.Prevent.Salud Públ. (Dpto. Microb.Med.Pr.,Sal.Públ.)
Área (Departamento): Área Tecnologi. Medio Ambiente (Dpto. Ing.Quím.Tecnol.Med.Amb.)
You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. You may not use the material for commercial purposes.
Exportado de SIDERAL (2020-01-17-22:12:08)
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El objetivo del trabajo es establecer el criterio de identidad que permita la comparación epidemiológica de los aislamientos de Giardia.
Se recogieron 2-3 muestras de heces en días alternos, de 26 pacientes con giardiosis. Tras la extracción de ADN, se amplificaron por técnicas de PCR, un fragmento del gen tpi y un fragmento del gen de la beta-giardina (bg), que se utilizó como comparación. Los fragmentos obtenidos fueron secuenciados y las secuencias analizadas con los programas BioEdit y DnaSP v.5.0. Las secuencias del gen tpi mostraron una elevada divergencia, con valores de diversidad ¿ entre 0 y 0, 21219. La aparición de picos múltiples en el cromatograma, indicaron la presencia de varios clones en la misma muestra. Las diferencias entre aislamientos del mismo paciente fueron iguales o mayores que las encontradas para el conjunto de todas las muestras.
La variabilidad del gen tpi no permite establecer unos criterios de identidad, necesarios para la identificación de aislamientos.
Las infecciones mixtas intragenotipo ocurren de una forma muy frecuente, sugiriendo una implicación de la vía ambiental como principal fuente de transmisión o una variación genética muy elevada.
Giardia duodenalis is a protozoon that causes infection in humans and animals. It can be transmitted by contaminated water, from person to person or by contact with animals; it being the cause one of the most common intestinal infections in our country, so it is a public health concern. The epidemiological study thereof requires the molecular characterization of parasites, using genes with great variability, such as the one that codes triosephosphate isomerase (tpi), and analizing the homology between isolates. The purpose of this work is to establish the identity criterion for epidemiological comparison of Giardia isolates. 2-3 stool samples were collected in alternate days from 26 patients with giardiasis. After DNA extraction, a fragment of the tpi gene and a fragment of the beta-giardin (bg) gene-used for comparison purposes-were amplified by means of PCR techniques. The obtained fragments were sequenced and the sequences analyzed with the BioEdit and DnaSP v.5.0 software. The tpi gene sequences showed a high divergence, with values of diversity ¿ ranging from 0 to 0.21219. The appearance of multiple peaks in the chromatogram points to the presence of various clones in the same sample. The differences between isolates from the same patient where equal or higher than those found for the collection of all samples. The variability of the tpi gene does not allow identity criteria to be established, which are necessary for isolate identification. Mixed intragenotype infections occur very frequently, which suggests the environmental path is the principal path of transmission and/or there is very high genetic variability.
Idioma: Español
Año: 2018
Publicado en: Revista de salud ambiental 18, 1 (2018), 78-84
ISSN: 1577-9572
Originalmente disponible en: Texto completo de la revista
Factor impacto SCIMAGO: 0.102 - Public Health, Environmental and Occupational Health (Q4) - Health, Toxicology and Mutagenesis (Q4)
Financiación: info:eu-repo/grantAgreement/ES/DGA/T51-17R
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