| TAZ-TFM-2017-935 |
Regulación Epigenética del locus Cd9 por REX1
Guevara Rodríguez, Susana
Schoorlemmer, Jon (dir.) ; Climent Aroz, María (dir.)
Universidad de Zaragoza,
CIEN,
2017
Departamento de Bioquímica y Biología Molecular y Celular, Área de Bioquímica y Biología Molecular
Máster en Biología Molecular y Celular
Resumen: El factor de transcripción REX1 controla la metilación en genes de impronta durante la embriogénesis temprana y participa en el silenciamiento de retrovirus endógenos (ERV). Se ha visto por ChiPseq que este factor tiene diana sobre el gen Cd9, que codifica para una proteína del mismo nombre que participa en múltiples actividades biológicas. Esta relación hace pensar en REX1 como regulador transcripcional de Cd9 mediante mecanismos epigenéticos. En el presente trabajo se estudió si REX1 es capaz de modular la expresión del locus Cd9. Con este fin, se determinó el porcentaje de metilación de secuencias genómicas de Cd9 cercano al pico de ChiPseq y los niveles de expresión de RNA del locus Cd9 por qPCR. Para ello analizamos muestras de tejidos y células de ratón (ES, TS, placentas y embriones) wt y las comparamos con REX1-/- y REX1+/-. Los resultados indican que REX1 actúa como protector de la metilación del locus analizado y represor de la expresión de Cd9. Este efecto parece no tener relación entre sí pues no existe una correlación negativa entre el grado de metilación del locus en los tejidos analizados y los niveles de expresión de Cd9. Es posible que la región analizada no sea determinante para el control de la expresión o que estén actuando otros mecanismos reguladores de la transcripción.
Tipo de Trabajo Académico: Trabajo Fin de Master
Notas: The transcription factor REX1 controls the methylation levels of imprinted genes during early embryogenesis and participates in the silencing of endogenous retroviruses (ERVs). It has been found by ChiPseq that this factor targets the Cd9 gene which encodes a protein with the same name that participates in multiple biological activities. This relationship suggests that REX1 act as a transcriptional regulator of Cd9 by epigenetic mechanisms. In the present work, we studied whether REX1 is able to modulate the expression of CD9 locus. To this end, the percent methylation of Cd9 genomic sequences close to the ChiPseq peak and the levels of RNA expression of the Cd9 locus by qPCR were determined. We analyzed cells and tissue samples from mouse (ES, TS, placentas and embryos) wt and compared them with REX1 - / - and REX1 +/-. The results indicated that REX1 acts as a protector of methylation of the Cd9 locus and repressor of its expression. This effect seems to be unrelated because there is no negative correlation between the degree of methylation of the analysed locus in these tissues and the levels of Cd9 expression. It is possible that this region is not determinant for the control of its expression, or other regulatory mechanisms of transcription are acting.
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